教练

退役后他先在汉堡展开教练生涯。数年后他转教拜仁慕尼黑时，赢得了执教生涯第一个德甲冠军；2007年他开始执掌德甲俱乐部沃尔夫斯堡，并在2008/09年赛季为球队首夺德甲冠军。

2009年，马加特宣布转投沙尔克04足球俱乐部，带领球队的首个赛季取得德甲亚军及翌年欧联入场劵。夏季马加特大举增兵，虽然在欧联晋级八强[1]，而德国杯亦在半决赛淘汰拜仁慕尼黑晋级决赛对德乙的杜伊斯堡[2]，但在联赛的成绩差劣，排在积分榜第10位，距离降级区域仅差5分，加上在买卖球员与董事会及球迷意见相左[3]，于2011年3月16日俱乐部召开特别会议后宣布提前20个月解雇马加特[4]。

遭革职后仅两天，马加特随即重返沃尔夫斯堡，担任主教练兼总经理，签约至2013年6月30日[5]。

于2013/2014年赛季，仅余下十三埸球赛的情况下，接任榜尾球队富勒姆教练，成为英超首位德籍教练，最终富勒姆依旧降级，但马加特并未离职。一般来说刚从英超降级的球队应该都能轻松在英冠留在非常前面的位子，可是下一季英冠开季七场竟然一场都没赢，仅得1和6负，在积分表敬陪末席，于是球队便把主教练马加特辞退。

2016年6月8日，山东鲁能泰山官方宣布，德国教练菲利克斯·马加特上任球队主教练。[6]